S-a descoperit că avionul acumulase un strat gros de gheaţă pe aripi şi pe parbriz. Anchetatorii au aflat această informaţie după ce au găsit cutia neagră a avionului. Aeronova mai avea doar 8 kilometri până la destinaţie, când piloţii au semnalat probleme tehnice, iar aeronava a dispărut de pe radar.
49 de pasageri şi membri ai echipajului, precum şi o persoană aflată la sol au murit în accident. Potrivit martorilor, avionul a intrat în picaj, izbindu-se cu botul de sol. Aparatul s-a prăbuşit peste o casă şi a luat foc. Alte două avioane de tip Dash 8, unul aparţinând companiei Malev, celălalt companiei Austrian Airlines au fost nevoite să aterizeze de urgenţă în Macedonia, imediat după decolare, din cauza unor probleme tehnice.
