Înainte să plece, Papa s-a rugat în Biserica Sfântului Mormânt din Ierusalim, unde tradiţia creştină spune că a fost înmormântat Iisus Hristos.
Benedict al XVI-lea şi-a început ultima zi în Israel cu o întâlnire cu patriarhul Ortodox al Ierusalimului, Teofil al III-lea. Benedict al XVI-lea a făcut un apel la unitate şi a vorbit despre ruşinea dezbinării dintre catolici şi ortodocşi.